Unipro UGENE: 統合バイオインフォマティクスツール
UGENEは無料のクロスプラットホーム・ゲノム解析スイートです。
このソフトを数回クリックしてインストールすればWindowsやMac OS、Linux上で完全な状態で使用することができます。

特徴

統合されたツール群
    * Multiple sequence alignment using MUSCLE 3, KAlign, Clustal;
    * HMM profiles build and search, based on the source of HMMER 2 and HMMER 3;
    * PCR Primers design using Primer 3;
    * Cloning in silico capabilities;
    * Queries to NCBI BLAST and CDD databases;
    * Protein secondary structure prediction using GOR IV and PSIPRED;
    * Phylogenetic analysis with Phylip;
    * Search for restriction enzymes and integration with REBASE;
    * Extremely fast repeat finder;
    * DNA reference assembly using Bowtie;
    * Search for transcription factor binding sites using SITECON;
    * Protein back translation;
    * ORF finder;
    * Complete Smith-Waterman algorithm implementation;
    * Support for external tools: BLAST+, MAFFT, T-Coffee. 

ユーザー・インターフェース
    * 環状プラスミドを含む可視的でインタラクティブなゲノム・ブラウジング
    * マルチプルアライメントエディタ
    * クロマトグラムの可視化
    * 3D viewer for files in PDB and MMDB formats with anaglyph stereo mode support;
    * 系統樹ビューアー
    * Dot plot visualization;
    * 複雑なアノテーション・パターンの検索に使用できるクエリ・デザイン
    * カスタムしたワークフローに対応した容易に使用できるワークフロー・デザイナー

UGENEを使った高機能な電算機計算
    * Complete support of modern multicore processors and SSE instructions;
    * Out of the box support of modern GPUs using NVIDIA CUDA and ATI Stream;
    * Support for cloud computing: running computational tasks on Amazon EC2 cloud;
    * Support for supercomputers and distributed computing. 

連携
    * 大学や学校における教育目的で使用することが可能です
    * 新しいリリースにはユーザー主導によって主導される改善点が含まれます
    * UGENEチームは無料であっても商用であってもいつでも協力する準備ができています